呈傘狀的噴霧是良好的信號的前提。可以通過源上的窗口對噴霧狀態(tài)進(jìn)行檢查，可借助手電筒放大鏡等工具以利于觀察。當(dāng)噴霧針傾斜以及堵塞都會導(dǎo)致噴霧狀態(tài)的良好性。

儀器的正常運(yùn)轉(zhuǎn)離不開真空度。當(dāng)真空度“太好"時(shí)需要注意儀器的碰撞氣是否足量以及毛細(xì)管是否堵塞。毛細(xì)管是前級電壓和大氣壓的通路，是確保真空度的重要組件。當(dāng)毛細(xì)管中間出現(xiàn)了污染或銹著造成毛細(xì)管堵塞。又或者當(dāng)儀器無法達(dá)到原有的真空度時(shí)有可能是機(jī)械泵的泵油泄露導(dǎo)致泵油不足、真空腔泄露，嚴(yán)重的則有可能是分子渦輪泵損壞。

電流可分為腔電流和毛細(xì)管電流。腔電流反映的是離子生成的效率，而毛細(xì)管電流反映的是離子傳輸?shù)男?。電流反映了離子遷移的情況，應(yīng)保持持續(xù)穩(wěn)定。對儀器進(jìn)行調(diào)諧時(shí)建議在做檢驗(yàn)調(diào)諧或者自動調(diào)諧的時(shí)候記錄每一次調(diào)諧的腔電流和毛細(xì)管電流，電流值維持穩(wěn)定則說明離子源狀態(tài)良好。需要注意的是電流值不應(yīng)出現(xiàn)數(shù)量級上的變化或成倍的衰減。

在質(zhì)譜故障的檢查前，需要去系統(tǒng)中生成的日志文件去查看具體的故障信息，來判斷需要對儀器進(jìn)行哪些操作。

質(zhì)譜故障排查前需要回憶。曾經(jīng)儀器做過哪些修改，而在修改后儀器出現(xiàn)了什么樣的現(xiàn)象。儀器在長時(shí)間的使用過程中，需要對某些具體的參數(shù)做以留意。例如：在每次調(diào)諧報(bào)告中的背景污染以及各離子的響應(yīng)、配置流動相、更換色譜柱等等都會對質(zhì)譜造成影響。